El primer Director de la Policía Nacional Civil fué el Doctor José María Monterrey, quien inició el despliegue de los agentes
Chalatenango fue el primer departamento donde se comenzó el primer despliegue en febrero de 1993, el cual finalizó a principios de 1994, después de cubrir los 14 departamentos y las cabeceras departamentales con mayor densidad poblacional.
Dr. José María Monterrey
El segundo Director , el Ingeniero Rodrigo Ávila, cargó con la responsabilidad de dar continuidad al cumplimiento de los Acuerdos de Paz pendientes en esos momentos
El ingeniero Ávila impulsó la organización de la Institución, creó las unidades especializadas del Mantenimiento del Orden (UMO), Grupo de Reacción Policial (GRP) y Grupo Aéreo Policial (GAP)
Ing. Rodrigo Avila Avilés
Lic. Mauricio Sandoval
El tercer Director, el Licenciado Mauricio Sandoval impulsó, desde su nombramiento en 1999, un nuevo modelo de seguridad pública basado en la participación ciudadana, un eje fundamental para la prevención del delito
Bajo la administración del Licenciado Sandoval, se creó la División Élite contra el Crimen Organizado (DECO) y se fortaleció la División Antinarcóticos (DAN) así como la Policía Científica del Delito y la Fundación de Bienestar Policial con el fin de apoyar el desarrollo integral del personal operativo entre otros.
Cmdo.
Ricardo Mauricio Menesses Orellana
Por primera vez, desde su creación, la Dirección General de la Policía ha recaído en un policía de carrera; aspecto que ha sido bien visto por diversos sectores de la vida nacional. Se trata del Comisionado Ricardo Mauricio Menesses Orellana, fue juramentado como Director General de la Policía Nacional Civil el 9 de mayo de 2003 por el ex Presidente Francisco Flores, fecha a partir de la cual da seguimiento al Plan General de Seguridad Ciudadana establecido para el quinquenio 2000- 2005
Ing. Rodrigo Avila Avilés
El ex Presidente de la República, Elías Antonio Saca, juramentó el día 5 de Febrero de 2008 en Casa Presidencial al ingeniero Francisco José Rovira como nuevo Director de la Policía Nacional Civil, en sustitución del Ingeniero Rodrigo Ávila, quien dejó el cargo el 25 de Enero
El Ingeniero Francisco José Rovira presentó su renuncia del cargo al ex Presidente Elías Antonio Saca el día 23 de Agosto del 2008
El comisionado Carlos Ascencio ingresó a la institución el 23 octubre de 1994 y tras graduarse como subcomisionado, se desempeñó como jefe de diferentes delegaciones como Cuscatlán, Sonsonate, San Vicente y San Miguel. Además fungió como jefe de la Región Central en 1997 y en 2005 formó parte de una misión de observadores de la ONU en Haití. En el 2007 integró una misión oficial de 
Estado en Nepal.
En 2009, con la llegada del partido FMLN a la presidencia de la República, el mandatario Mauricio Funes lo nombró Director General de la PNC, cargo que desempeñó hasta enero del 2012.
Actualmente se desempeña como embajador de El Salvador en México.
El 1 de enero de 2006 y por instrucciones del ex Presidente de la República,. Don Elías Antonio Saca, el Ingeniero Rodrigo Avila retornó a la Dirección General de la PNC para hacerse cargo de las riendas de la institución. Durante su segundo período, el Ing. Avila creó las unidades del Grupo de Operaciones Especiales Policiales (GOPES), la División de Cumplimiento de Disposiciones Judiciales (DCJ) y la Unidad de Interceptores de Tránsito, con las que la operatividad se vio fortalecida. Además, hizo posibles mejoras salariales y otras prestaciones para los agentes policiales, inició los cursos de ascensos de oficiales y optimizó las coordinaciones con la Fiscalía General de la República para que los casos fueran investigados en forma exhaustiva, lo que permitió que peligrosos delincuentes hayan enfrentado a la justicia.
Uno de los principales logros del Ing. Avila en su segunda gestión, que concluyó el 31 de enero de 2008, fue la sensible reducción de todos los delitos a niveles históricos, gracias a la operatividad desarrollada por medio de la Orden de Operaciones “Sarissa”, que fue creación suya y que ha permitido a la población percibir un país más seguro
Ing. Francisco José Rovira
El 1ro de Septiembre de 2008 en Casa Presidencial, el ex Presidente Elías Antonio Saca juramentó al Comisionado José Luis Tobar Prieto como nuevo Director General de la Policía Nacional Civil en sustitución del Ing. Francisco Rovira quien dejó su cargo el 23 de Agosto de 2008
Cmdo. José Luis Tobar Prieto
Gral. de Div. (r) Francisco Ramón Salinas Rivera
El 23 de Enero de 2012, el presidente de la República Carlos Mauricio Funes Cartagena, juramento al Gral. de Div. (r) Francisco Ramón Salinas Rivera como nuevo Director General de la Policía Nacional Civil en sustitución del Comisionado Carlos Asencio Girón.
Cmdo. Carlos Asencio Girón
Gral. Francisco Ramón Salinas Rivera
